Skip to content

Instantly share code, notes, and snippets.

@0x1d107

0x1d107/doi2bib.sh

Created December 14, 2025 09:23
Show Gist options

  • Select an option

    Learn more about clone URLs
  • Save 0x1d107/3fb99251b62d5086a4e2a510013238ec to your computer and use it in GitHub Desktop.

Select an option

Learn more about clone URLs
Save 0x1d107/3fb99251b62d5086a4e2a510013238ec to your computer and use it in GitHub Desktop.
Download ZIP
scripts for bibliography management
Raw
doi2bib.sh
#1/bin/bash
SHDIR=$(dirname $(readlink -f $0))
curl -LsH 'Accept: application/x-bibtex' "https://api.crossref.org/works/$(jq -sRr @uri)/transform"| awk -f $SHDIR/prettybib.awk
Raw
prettybib.awk
BEGIN{FS=""}
{
gsub(/^[ \t]+/,"",$0)
for(i=1;i<=NF;i++)
if($i=="{") {
lvl++;
printf("{");
}else if($i == "}"){
if(lvl == 1)
print("")
lvl--;
printf("}");
if(lvl == 0)
print("");
}else if($i == "," && lvl == 1){
print(",");
for (k=0;k<lvl;k++)
printf(" ");
}else
printf("%s",$i);
}
Raw
sebzer.js
// ==UserScript==
// @name Sebzer
// @namespace https://p1m.org/
// @version 0.2.8
// @description Средство экспорта библиографических записей из eLIBRARY.RU (СЕБЗЕР). Добавляет в eLIBRARY.RU возможности экспорта библиографических записей, подобные таковым в PubMed. В настоящее время поддерживается экспорт только со страниц выдачи, только с ограничением по типу публикации «статьи в журналах» и только в формате BibTeX.
// @author Павел Желнов
// @match http*://*.elibrary.ru/*
// @grant none
// @require https://cdn.rawgit.com/eligrey/FileSaver.js/v2.0.2/dist/FileSaver.min.js
// @require https://cdn.jsdelivr.net/npm/citation-js@0.4.10/build/citation.min.js
// ==/UserScript==
$(function() {
'use strict';
var elibrary = "https://elibrary.ru";
const Cite = require('citation-js');
const record = new Cite();
var sebzer_bibtex = function () {
let record = new Cite();
parseSearch(record);
var text = record.format('bibtex');
var blob = new Blob([text], {type: mime});
saveAs(blob, filename+"."+ext);
};
var sebzer_copy_bibtex = function () {
let record = new Cite();
parseSearch(record);
var text = record.format('bibtex');
navigator.clipboard.writeText(text);
};
window.sebzer_copy_bibtex = sebzer_copy_bibtex;
var canvas = '<div id="sebzer-canvas"></div>';
var style = "width: 630px; text-align: justify; padding: 10px; margin: 10px; background-color: #555555; color: white";
var button = '<div id="sebzer-button-canvas"><table>';
button+='<tr><td width="15%" align="center" valign="top"><a id="sebzer-button-pic" href="javascript:sebzer_bibtex()" style="color: white"><img src="images/but_orange.gif" width="15" height="15" hspace="3" border="0"></a></td><td width="85%" align="left" valign="middle"><a id="sebzer-button-text" href="javascript:sebzer_bibtex()" style="color: white">';
button += 'Экспортировать в файл (BibTeX)';
button += '</a></td></tr>';
button+='<tr><td width="15%" align="center" valign="top"><a id="sebzer-button-pic2" href="javascript:sebzer_copy_bibtex()" style="color: white"><img src="images/but_orange.gif" width="15" height="15" hspace="3" border="0"></a></td><td width="85%" align="left" valign="middle"><a id="sebzer-button-text2" href="javascript:sebzer_copy_bibtex()" style="color: white">';
button += 'Копировать BibTeX';
button += '</a></td></tr>';
button+='</table></div>';
var eSebzerNote = '<div id="sebzer-esebzernote" style="font-weight: bold; color: #F26C4F"><p style="text-indent: 0">';
eSebzerNote += 'СЕБЗЕР';
eSebzerNote += '</p></div>';
var eNotArticleNote = '<div id="sebzer-enotarticlenote"><p style="text-indent: 0">';
eNotArticleNote += 'В выдаче обнаружены записи с типом публикации, отличным от «статьи в журналах». Обращаем внимание, что такие записи не будут полноценно распарсены. Для исключения таких записей можно в параметрах поиска снять галочки со всех остальных типов публикации.';
eNotArticleNote += '</p></div>';
var eNotSearchNote = '<div id="sebzer-enotsearchnote"><p style="text-indent: 0">';
eNotSearchNote += 'Это не поисковая выдача, поэтому экспорт записей с этой страницы, если таковые на ней имеются, не будет возможен. Вы сможете выгрузить эти записи, если добавите их в какую-либо подборку публикаций, так как экспорт содержимого таких подборок — возможен.';
eNotSearchNote += '</p></div>';
var eItemAspNote = '<div id="sebzer-enotsearchnote"><p style="text-indent: 0">';
eItemAspNote += 'Экспорт со страниц отдельных записей не поддерживается. Чтобы преодолеть это ограничение, добавьте эту запись в какую-либо подборку и затем выгрузьте содержимое этой подборки.';
eItemAspNote += '</p></div>';
var e = { notSearch: false, itemAsp: false, popUpWindow: false, notArticle: false };
var mime = "application/x-bibtex;charset=utf-8";
var filename = 'elibrary_ru';
var ext = "bib";
var ref_regex = /^(.+)\. (\d{4})\. (Т\.? ([\d\wА-я.\-\(\) ]+)\. )?(№\.? ([\d\wА-я.\-\(\) ]+)\. )?(С)\. ([\d\w\-]+)\.$/i;
var au_regex = /^(.*?) ?([^ ]+?)\.?$/i;
var bib_regex = /^@\w+{.*,$/gmi;
function parseSearch(record){
if (!$('#thepage').length || $('#thepage').prop('outerHTML').toLowerCase().search(/всего найдено публикаций:\s+<\/font>/) === -1) {
e.notSearch = true;
var pagename = location.pathname.substring(1);
switch(pagename) {
case 'item.asp':
e.itemAsp = true;
break;
case 'itembox_item_add2.asp':
case 'itembox_item_add.asp':
e.popUpWindow = true;
break;
}
}
else $('tr').filter(function(){
return this.id.match(/^a\d+$/g);
})
.children().filter('td[align="left"]').each(function(){
var bibjson = {type: "misc"};
var bibkey = $(this).parent().attr('id');
let checked = $('#tid'+bibkey.slice(1))[0].checked;
console.log('#tid'+bibkey.slice(1));
console.log($('#tid'+bibkey.slice(1))[0].checked);
if(!checked && checked !== undefined)
return;
var hasAuthor = ($('font',this).has('i').length == 1) ? true : false;
if (hasAuthor) {
var author = [];
var austr = $('font',this).has('i').not(':has(b)').text().replace('et al.','').trim();
var auarr = austr.split(', ');
auarr.forEach(function(val, i) {
var au = val.match(au_regex);
var name;
if (au[1]) {
var lastname = au[1];
var firstname = au[2].replace(/[^a-za-я\d]+/gi,'. ')+".";
name = lastname + ', ' + firstname;
author.push({
lastname: lastname,
firstname: firstname,
name: name
});
}
else {
name = au[2];
author.push({
lastname: name,
firstname: name,
name: name
});
}
});
bibjson.author = JSON.parse(JSON.stringify(author));
}
var hasTitle = ($('span',this).has('b').length) ? true : false;
if (hasTitle)
bibjson.title = $('span',this).children().has('b').text().trim();
var hasRef = ($('span',this).children().not(':has(i),:has(b)').length) ? true : false;
if (hasRef) {
var refstr = $('span',this).children().not(':has(i),:has(b)').text().replace(/\s+/g,' ').trim();
var refarr = refstr.match(ref_regex);
if (refarr) {
bibjson.type = "article";
bibjson.journal = {name: refarr[1]};
bibjson.year = refarr[2];
if (refarr[4])
bibjson.journal.volume = refarr[4].replace(/^(\d+).*$/,"$1");
if (refarr[6])
bibjson.journal.issue = refarr[6].replace(/^(\d+).*$/,"$1");
bibjson.journal.pages = refarr[8].replace('-','--');
if (!hasAuthor)
bibjson.author = [{name: "Б.а."}];
if (!hasTitle)
bibjson.title = "Б.н.";
}
else {
e.notArticle = true;
bibjson.note = refstr;
if (refstr.match(/^\d{4}$/))
bibjson.year = refstr;
}
}
var hasUrl = ($('span',this).children().eq(0).has('[href]')) ? true : false;
if (hasUrl) {
var url = elibrary + $('span',this).children().eq(0).attr('href');
var link = [{url: url}];
bibjson.link = link;
}
var bibtex = new Cite(bibjson).format('bibtex');
var label = "@" + bibjson.type + "{" + bibkey + ",";
bibtex = bibtex.replace(bib_regex, label).replace(/\{\\[^\}]+}/g,'�');
record.add(bibtex);
});
}
if (!e.popUpWindow) {
$('table').before(canvas);
$('#sebzer-canvas').attr("style", style);
$('#sebzer-canvas').append(eSebzerNote);
if(e.notSearch) {
var note = (e.itemAsp) ? eItemAspNote : eNotSearchNote;
$('#sebzer-canvas').append(note);
}
else {
if(e.notArticle)
$('#sebzer-canvas').append(eNotArticleNote);
$('#sebzer-canvas').append(button);
$('#sebzer-button-pic').click(sebzer_bibtex);
$('#sebzer-button-text').click(sebzer_bibtex);
}
}
});
Sign up for free to join this conversation on GitHub. Already have an account? Sign in to comment